Realtime PCR là gì? những điều lưu ý cần thiết khi chọn máy realtime - PCR

Realtime PCR là gì? những điều lưu ý cần thiết khi chọn máy realtime - PCR

I. Máy realtime PCR là gì? Phân biệt PCR và RT-PCR

Real-time PCR (RT-PCR), hay PCR theo thời gian thực, là một kỹ thuật sinh học phân tử hiện đại giúp định lượng DNA hoặc RNA một cách chính xác trong quá trình khuếch đại. Nó được gọi là qPCR (quantitative PCR) vì khả năng định lượng DNA (hoặc axit nucleic) trong mẫu ngay trong thời gian thực.

Cách thức hoạt động 

1. Khuếch đại: DNA hoặc RNA được khuếch đại bằng cách sử dụng các đoạn mồi (primers) đặc hiệu và enzyme DNA polymerase. Giống như PCR thông thường, quá trình khuếch đại DNA được thực hiện thông qua các chu kỳ nhiệt để nhân bản đoạn DNA mục tiêu.

2. Phát hiện và ghi lại tín hiệu huỳnh quang:

- Trong mỗi chu kỳ khuếch đại, tín hiệu huỳnh quang được phát ra. Tín hiệu này tăng dần theo lượng DNA được khuếch đại.

- Trong từng chu kỳ PCR, máy sẽ đo lượng tín hiệu huỳnh quang phát ra từ các chất nhuộm hoặc đầu dò gắn vào DNA.

- Mức độ tín hiệu này tỷ lệ thuận với lượng DNA sợi kép được nhân bản.

3. Phân tích thời gian thực:

- Máy tính toán và hiển thị mức độ tích lũy DNA theo thời gian dưới dạng biểu đồ khuếch đại (amplification curve).

- Tín hiệu huỳnh quang vượt ngưỡng nền (baseline) tại chu kỳ cụ thể gọi là chu kỳ ngưỡng (Ct hoặc Cq), giúp định lượng DNA ban đầu.

 

4. Sự khác nhau giữa Realtime PCRPCR truyền thống nằm ở nguyên tắc hoạt động, mục đích và cách xử lý sản phẩm DNA. Dưới đây là so sánh chi tiết:

Tiêu chí

Realtime PCR

PCR truyền thống

Phương pháp phát hiện

Sử dụng tín hiệu huỳnh quang để theo dõi sự khuếch đại DNA ngay trong quá trình phản ứng.

Phân tích sản phẩm DNA sau khi phản ứng hoàn tất, thường bằng gel điện di.

Định lượng DNA

Định lượng DNA theo thời gian thực (định lượng tương đối hoặc tuyệt đối).

Không định lượng được, chỉ cho biết có hoặc không có DNA.

Độ nhạy

Cao hơn nhờ đo tín hiệu huỳnh quang từng chu kỳ.

Thấp hơn, dễ bị giới hạn bởi độ nhạy của gel điện di.

Tốc độ phân tích

Nhanh hơn, không cần bước xử lý sau (hậu PCR).

Chậm hơn do cần bước phân tích sản phẩm (chạy gel, nhuộm màu).

Nguy cơ nhiễm chéo

Thấp hơn, không cần mở ống sau phản ứng.

Cao hơn do phải mở ống để xử lý sản phẩm DNA.

Ứng dụng

Phát hiện và định lượng virus, vi khuẩn, phân tích gen, kiểm tra đột biến.

Xác nhận sự hiện diện của DNA, nhân bản DNA để nghiên cứu.

Chi phí

Cao hơn do yêu cầu thiết bị và hóa chất đặc biệt.

Thấp hơn, sử dụng thiết bị và hóa chất đơn giản.

Biểu diễn kết quả

Dạng biểu đồ khuếch đại và Ct (chu kỳ ngưỡng).

Dạng băng DNA trên gel agarose.

II. Những điều lưu ý cần thiết khi chọn máy realtime PCR

để lựa chọn máy PCR phù hợp với nhu cầu bạn cần xem xét một số yếu tố sau: 

- Số lượng xử lý mẫu( công suất mẫu)Máy realtime PCR thường có các cấu hình giếng khác nhau như 48 wells, 96 wells, hoặc 384 wells

- Độ nhạy và độ chính xác : Độ nhạy cao để phát hiện được lượng DNA/RNA rất thấp(10 copies). Máy cần đảm bảo độ chính xác việc định lượng, đặc biệt các ứng dụng yêu cầu nghiện cứu ung thư hoặc kiểm tra tải lượng virus.

- Số kênh huỳnh quang (multiplexing): Số kênh phát hiện: Máy có từ 1-6 kênh để đo tín hiệu huỳnh quang từ các chất nhuộm khác nhau. 1-2 kênh: đủ dùng nếu chỉ chạy thí nghiệm đơn giản( ví dụ: một mục tiêu DNA). 4-6 kênh: cần thiết nếu thực hiện phản ứng multiplex

- Phân tích dữ liệu và phần mềm: Bên cạnh phần cứng thì phần mềm cũng là 1 tiêu chí nên đưa ra để lựa chọn một dòng máy. Phần mềm nên có những thông tin căn bản, cần thiết để người dùng dễ tiếp cận trong việc thao tác cũng như phân tích kết quả thí nghiệm. Đánh giá phần mềm được cung cấp kèm theo máy. Nó sẽ cung cấp giao diện người dùng trực quan, công cụ phân tích dữ liệu và khả năng xuất dữ liệu ở các định dạng tương thích. Kiểm tra xem phần mềm có cho phép tùy chỉnh các tham số thử nghiệm hay không và liệu phần mềm có cung cấp các tính năng như xác định ngưỡng tự động và phân tích biểu thức chuẩn hóa hay không.

- Hỗ trợ và dịch vụ: Xem xét danh tiếng của nhà sản xuất và các dịch vụ hỗ trợ khách hàng. Hãy tìm một công ty cung cấp dịch vụ hỗ trợ kỹ thuật, đào tạo và bảo trì. Kiểm tra sự sẵn có của phụ tùng thay thế và thời gian bảo hành được cung cấp cho máy. 

- Ngân sách: Máy có thể có giá tùy thuộc vào các tính năng và khả năng mà chúng cung cấp. Xác định ngân sách của bạn và xem xét các chi phí dài hạn liên quan đến máy, bao gồm thuốc thử, vật tư tiêu hao và khả năng nâng cấp.

- Đánh giá và tài liệu tham khảo của người dùng: Đọc các đánh giá và tìm kiếm phản hồi từ các nhà nghiên cứu khác, những người đã sử dụng máy. Kinh nghiệm của họ có thể cung cấp thông tin chi tiết về hiệu suất, độ tin cậy và khả năng sử dụng của máy. 

- Ứng dụng cụ thể: Xác định rõ nhu cầu ứng dụng như: 

+ Chẩn đoán bệnh: Yêu cầu độ nhạy và độ chính xác cao. 

+ Nghiên cứu gen: Cần nhiều kênh huỳnh quang. 

+ Kiểm tra tải lượng virus: Cần tốc độ và độ nhạy cao.

Các sản phẩm model tủ an toàn sinh học đang được phân phối tại ANHOACO (LH: 0819.320.816)

Máy realtime PCR 16 vị trí Model realtime16 hãng AS ONE(LH: 0819.320.816)

 

Máy realtime PCR 96 vị trí Model CIelo 6 - AIQ060 hãng AS ONE LH tư vấn: 0819.320.816)

Công ty chúng tôi cung cấp nhiều Thiết bị realtime PCR các hàng chính hãng khác vui lòng liên hệ 0819.320.816 để biết thêm thông tin 

 

  

Công Ty TNHH Đầu Tư Phát Triển Thương Mại An Hòa

Thông tin liên hệ:

Hân hạnh được phục vụ quý khách hàng trong những dự án sắp tới!

  • Chúng tôi sẽ cung cấp cho khách hàng đa dạng các sản phẩm với xuất xứ chính hãng.

  • Hỗ trợ giao hàng đến tận nơi với thời gian ngắn nhất có thể.

  • Cung cấp dịch vụ bán hàng và chăm sóc khách hàng, sửa chữa tốt nhất.

  

Share :

Viết bình luận